What happened??
Hi!
I apologize for the extremely poor updates!!!
After the last post I had my vacation, a week off, when I traveled back home to see my family. That week was then followed by two intensive weeks of research where I performed more serum assays and wrote a report based on the results. At the end, I turned out to analyze the immunogenicity (the ability of a particular substance to provoke an immune response) for two different DNA-plasmids, both based on the HIV gene encoding Reverse Transcriptase (RT), and the impact of injection site. One DNA-plasmid was modified to maximize the gene expression, whilst the other one in addition was modified to be secreted (normally RT exists inside cells). The plasmids were injected either intradermally (into the second one of the three skin layers) or intramuscularly (into the muscles). The results didn’t show any clear differences between the immunogenicity of the plasmids, but they are indicating that intradermal injections induce a stronger immune response than the intramuscular ones. Further experiments will be done by the research team to ensure this, and to determine which one of the plasmids that is preferably for a potential DNA-vaccine. Nevertheless, they are going to use my results in their research, and I’m included as co-author in the abstract that they’ve sent in to AIDS Vaccine Meeting in Barcelona. I’m so excited! I’m also planning to use my results to participate in an exhibition for young scientists called Utställningen Unga Forskare, which will take place in the spring. That will also be very exciting!
The last week we had interesting visits to i.a. MR-Centre, lectures and presentations where we presented our projects to each other. On Friday we had a closing dinner where we received our diplomas from Gerald McInerney, director of studies at KI and responsible for the summer research school. It was the last time we all were gathered together and I couldn’t help getting tears in my eyes when saying goodbye… I’ve really had a fantastic summer with my course mates and leaders, and I’m so glad that I took the chance to participate in the research school!!!
I’d really like to thank my supervisors Maria Issagouliantis and Stefan Petkov who provided me with this opportunity, who assisted me with invaluable support and who kindly took care of me during the whole summer. Thank you!
I’d also like to thank Gerald McInerney and the fantastic assistants Puran Chen, Stina Sellberg and Angelica Joelsson! No matter the case, they were always there to help, and always with a smile on their face. Thank you!
Last, but absolutely not least, I’d like to thank all the amazing participants! Alva, Julia, Isabelle, Moa, Mikaela, Ida, Karl, Ebba, Simon, Shamim, Sara, John, Jens, Emilia, Olga, Klas, Martin, Jessica and Amanda. Thank you for making this an unforgettable summer!!!
Vad hände??
Hejsan!
Jag ber om ursäkt för den extremt dåliga uppdateringen!!!
Efter det senaste inlägget hade jag min semester då jag åkte ner till Skåne en vecka, träffade familjen, åkte på Falsterbo Horse Show och var på Ven.
Semesterveckan följdes av två intensiva sista forskningsveckor med fler serumsanalyser och mycket rapportskrivning. Slutligen blev det så att jag i huvudsak analyserade immunogeniciteten (förmågan hos ett ämne att framkalla ett immunsvar) hos två olika DNA-plasmider baserade på HIV-genen för Reverse Transcriptase (RT), och injektionsställets betydelse för denna. Den ena DNA-plasmiden var modifierad för att maximera genuttrycket, medan den andra dessutom var modifierad för att det uttryckta proteinet skulle utsöndras (normalt sett finns RT inne i celler). Plasmiderna injicerades antingen intradermalt (i det mittersta av hudens tre skikt) eller intramuskulärt (in i musklerna). Resultaten visade inga tydliga skillnader på DNA-plasmidernas immunogenicitet, men de tyder på att intradermala injektioner framkallar ett starkare immunsvar. Forskargruppen kommer att göra fler försök för att säkerställa detta, samt för att bestämma vilken DNA-plasmid som är lämpligast för ett eventuellt DNA-vaccin. De kommer dock att använda mina resultat i sin forskning, och jag står med som co-author i det abstract som de har skickat in till AIDS Vaccine Meeting i Barcelona nu i oktober. Jag är så exalterad! Resultaten jag fick tänker jag också använda för att vara med på Utställningen Unga Forskare i vår, vilket kommer att bli jättespännande!
Sista veckan bjöd på intressanta studiebesök (bl.a. på MR-Centrum!) och föredrag om bland annat immunologi, samt presentationer där vi berättade om våra projekt. På fredagen hade vi avslutningsmiddag där vi fick ta emot våra diplom från Gerald McInerney, studierektor på KI och ansvarig för sommarforskarskolan. Det var sista gången vi var samlade alla tillsammans och jag kunde inte undgå att bli tårögd när vi skiljdes åt… Jag har verkligen haft en helt fantastisk sommar med både kursdeltagare och ledare, och jag är så otroligt glad att jag tog chansen att vara med i sommarforskarskolan!!!
Ett stort tack till mina handledare Maria Issagouliantis och Stefan Petkov som ställt upp och gett mig den här möjligheten. Under hela sommaren har de bistått mig med ovärderlig support. Tack!
Jag vill också tacka Gerald McInerney och de fantastiska amanuenserna Puran Chen, Stina Sellberg och Angelica Joelsson! Oavsett vad det gällt har de funnits där, alltid lika hjälpsamma och med ett leende på läpparna. Tack!
Sist men absolut inte minst, vill jag tacka alla underbara deltagare! Alva, Julia, Isabelle, Moa, Mikaela, Ida, Karl, Ebba, Simon, Shamim, Sara, John, Jens, Emilia, Olga, Klas, Martin, Jessica och Amanda. Tack för att ni har gjort detta till en oförglömlig sommar!!!
English posts!
From now on I will do some English posts too since some of my followers are from abroad! Welcome to my blog:)
So, I’m one of the lucky 20 to attend to KI’s summer research school this year. Here you can find some information about it in English: http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp;jsessionid=a2Tji6rNkb2dpgvBB_?l=en&d=4178
I've been here since the 14th of June, with exception for Midsummer. The first week was an introduction week where we attended to different interesting lectures and had many social activities to get to know each other. We also spend a weekend in the Swedish archipelago. It was really nice!
Last week I got to meet with my supervisor and I was introduced to the research team. They are doing research on a DNA-vaccine against primarily HIV-1 and HCV, check out this link for more information: http://ki.se/ki/jsp/polopoly.jsp?d=23486&a=112987&l=en
My part in this project is to analyze what kind of immune response that develops depending on the used injection method. We are going to analyze three different methods: intradermal injection using a normal needle, intradermal injection using a micro needle, and injection using a biojector (i.e. very high pressure). Last week I got to try to analyze what kind of antibodies there were present in serum from several different mice, using the indirect ELISA method: http://www.elisa-antibody.com/ELISA-Introduction/ELISA-types/indirect-elisa We used different types of secondary antibodies to detect if the primary antibodies originated from the cellular or the humoral immune system.
This week it seems as if I’m going to purify DNA-plasmids using bacteria. Cool! It’s the DNA-plasmids that later on are injected as a DNA-vaccine: http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_vaccination
This is very briefly what has happened so far:) Feel free to take a look at the pictures that I’ve published before!:)
Nu har även jag en DN!;)
Phu! Idag har det varit mycket att läsa och tyvärr inget labbarbete. Fick dock sluta lite tidigare än vanligt:) Jag åkte in till stan, och eftersom jag var själv tog det givetvis jättelång tid innan jag hittade dit jag skulle;) Men nu har jag uträttat mina ärenden, och där ingick givetvis att köpa en DN! Var rätt kul att läsa:)
Tidningsartikeln har blivit publicerad!
Artikeln i DN blev publicerad idag! Ska försöka köpa en bilaga på vägen hem. Bilden fick jag skickad till mig av en kompis:)
Söndag:)
Jag ber om ursäkt för den dåliga uppdateringen! Har varit krångel med bloggen både idag och igår, så inlägg som jag trott blivit publicerade har tyvärr inte blivit det. Det har i alla fall varit en superrolig helg:) Igår var det fest hemma hos John på Östermalm. Wow wow wow är det enda jag kan säga! Såå coolt. Idag har varit lugnt, städat lite, lagat maaassor med köttfärssås, tränat och varit med de goa sofoarna:) Jag sitter nere vid vattnet o skriver o får besök av många små nyfikna figurer;) Men nu måste jag hem o läsa lite artiklar inför imorgon!
Snabb uppdatering!
Tjoho vad tiden flyger! Måste ta och uppdatera er;) I fredags var det mycket jobb med elisorna och vi fick fram våra resultat. Eftersom vi använde mycket lägre koncentrationer av serumen denna gång, blev resultaten mycket bättre. När vi höll på med elisorna tog washing buffern slut och vi fick göra ny, samt se världens största mätglas!!;) Nästa vecka ska vi få lov att renframställa dna-plasmider!! Ska bli väldigt kul:))
På vägen hem mötte jag upp med en kompis, tog en lyxshake och gick en lång promenad. Mysigt:) På kvällen blev det sedan utgång med alla från jägargatan och två till:) Idag har varit en skön o lugn dag, varit och handlat och sedan var vi ett gäng som tränade. Nu sitter jag och väntar på de andra för att åka till en av sofoarna på tacokväll. Mums!
Första JC:n avklarad:)
Nyss hemkommen från den första journal cluben:) Den var väldigt intressant! En av författarna till artikeln vi läste kom dit och förklarade vad de hade gjort, hur man bäst förbereder sig inför JC:s och hur man går tillväga för att få en artikel publicerad. Artikeln vi läste var "GABAergic Signaling Is Linked to a Hypermigratory Phenotype in Dendritic Cells Infected by Toxoplasma gondii". Om ni söker på det på Google kommer artikeln upp högst upp;) Det har visat sig att T. Gondii tar sig in i våra dendritiska celler, som egentligen är en del av vårt immunsystem(!), och sedan tvingar dem att föra dem till hjärnan. Där kan de manipulera oss på olika sätt genom att få sin värdcell att utsöndra neurotransmittorn GABA. Lite läskigt!
På eftermiddagen i labbet fortsatte vi med våra elisor. Blev lite krångel när vi skulle räkna ut de olika koncentrationerna men annars gick det bra:)
Nu ska jag fixa plats åt Alva på mitt rum, hon glömde sina nycklar i labbet! Så ikväll blir det pyjamasparty;)
Varit hos mössen!
I förmiddags gick vi ner till mössen för att för första gången prova några nya micronålar och injektionsmetoder. Stefan (min "vice handledare") var tvungen att lära sig metoden perfekt inför att de riktiga experimenten ska börja. Idag övade han på två döda möss och injicerade bara en blå buffert. Vi filmade så att företaget som tillverkar nålarna ska kunna komma med tips och förbättringar.
Innan man gick in fick vi byta om till speciella kläder (t.o.m strumporna skulle bytas!), tvätt oss noga och sätta på oss mössor. Givetvis var det coolt att få komma ner där, men djurvän som jag är var det med blandade känslor som jag gick därifrån...
Inga foton som togs inne i djurhuset får publiceras, så här får ni istället en bild på mig och Shamim (min labbpartner) från omklädningsrummet:) tyvärr utan de roliga mössorna;)
Resultatet från igår
Har precis ätit frukost efter att ha sprungit nu på morgonen, det gav en riktig kick igår och kände att jag kunde behöva en likadan idag!;) bifogat ser ni resultatet av våra första "elisor". Proverna färgades blåa alldeles för fort, och nu i nästa elisa (som vi började på igår) ska vi använda en mycket lägre koncentration av serumet (proverna blev gula när en syra tillsattes för att stoppa reaktionen som genererade den blåa färgen). Detta som vi gör nu är egentligen inte det projekt som jag blivit tilldelad, men det börjar inte förrän 8juli, och egentligen kommer de sista provresultaten att komma kring den 2augusti då vi redan ska vara klara och ha redovisat...men det löser sig! Den första provtagningen kommer att ske på dag 15 (den 23:e juli) så förmodligen får jag basera mitt arbete på dem.
Full rulle!
Idag har varit intensivt med mycket labbande och mycket att läsa och förstå. På vägen hem tog jag en annan lite längre väg så att jag fick gå en mysig promenad längs vattnet, och nu har jag precis kommit tillbaka från min springrunda. Skönt att få lite ordning på allt som snurrar i huvudet!
Nu väntar dusch och sedan blir det pannkakor som Alva och Mikaela bjuder på. Ska bli gott att smaska på när man läser artiklar:)
Sist men inte minst: stort grattis till Emilia som fyller 18 idag!!
Mitt rum:)
Sitter på tåget påväg mot KI och tänkte att det kunde vara kul för er att se hur jag bor, så här kommer lite bilder!:)
Tiden går fort när man har kul!
Jisses vad tiden går fort! Men så är det väl när man har roligt;) Igår var min första dag på labbet, det blev mycket genomgång och demonstration men idag har även jag fått göra lite laborativt arbete bestående av en massa pipettering. Forskargruppen som jag är med i jobbar på att ta fram ett dna-vaccin mot hiv, väldigt spännande! Jag har fått ut massor med material som jag jobbar med. För er som är intresserade förklaras principen för dna-vaccination väldigt bra här: http://en.m.wikipedia.org/wiki/DNA_vaccination
Forskargruppen har injicerat möss med ett dna-vaccin (i detta fall mot hiv reverse transcriptase) så att de producerat antikroppar, och det vi nu håller på med i labbet är att analysera hur stor andel av antikropparna som härstammar från det humorala respektive det cellulära immunsystemet. Detta gör vi med hjälp av indirekt ELISA: http://www.elisa-antibody.com/ELISA-Introduction/ELISA-types/indirect-elisa
Det är alltså vad som för tillfället pågår i labbet:)
Igår gick jag även en sväng på stan med en kompis och hämtade ut mina nya glasögon, samt inhandlade lite saker som jag glömt när jag var hemma över midsommar;) sedan mötte vi upp de andra sommarforskarna (sofoarna) och fikade tillsammans i nån park som jag inte minns namnet på, innan vi åkte tillbaka till KI för filmkväll. Vi såg Contagion haha;)
Just det! Idag på förmiddagen blev jag och min labbpartner intervjuade av Dagens Nyheter:) Det blev en ganska lång intervju (närmare 1,5h!) och jag är väldigt nyfiken på att få läsa artikeln! Reportern visste inte riktigt när den skulle publiceras, men hon lovade att höra av sig.
Nu måste jag återgå till mina artiklar. Jag håller på att förbereda mig inför den första journal cluben.
Sov gott!
Mot Stockholm igen!
Väntar just nu på att få gå på planet mot Stockholm. Ska bli väldigt spännande att få komma tillbaka för imorgon börjar min labbtid! Förra veckan var introduktionsvecka där vi bl.a var på kollo i skärgården, men det var inget labbarbete. Dock träffade jag min handledare och hon verkar väldigt trevlig! I torsdagskväll åkte jag hem för att fira midsommar och nu är jag som sagt påväg tillbaka:)
